Тест в тот же день помогает выявлять скрытые инфекции у тяжело больных детей
Пионерский тест, дающий результат в тот же день, использовали для обнаружения скрытых и лекарственно-устойчивых инфекций у детей в отделениях интенсивной терапии.
Респираторные образцы более чем 100 тяжело больных маленьких пациентов Лондонской больницы Грейт-Ормонд-стрит (GOSH) были отправлены на так называемое метагеномное тестирование.
Этот метод позволяет выявлять бактерии, вирусы и грибы из одного образца, что во многих случаях влияет на то, какие препараты назначают врачи.
Метагеномика способна обнаруживать инфекции, которые пропускают стандартные тесты, что означает лучшие исходы для некоторых тяжело больных пациентов.
Случай Уиллоу Краутер
В марте 10-летняя Уиллоу Краутер тяжело заболела пневмонией, что вызвало судорогу и несколько остановок сердца.
Уиллоу, жительница Кента, была госпитализирована в отделение интенсивной терапии GOSH. Ее матери Стейси Мур сообщили, что вероятность выживания составляет 50%.
«Консультант сказал… что нам нужно привести семью, чтобы попрощаться с ней. Она была в таком критическом состоянии и в такой большой опасности смерти», — рассказала мать.
Команда GOSH использовала метагеномику — диагностический тест, который работает путем секвенирования всего генетического материала в образце, в отличие от традиционных методов, когда клиницисты заранее должны решить, что именно они ищут.
Тест выявил, что у Уиллоу была лекарственно-устойчивая бактериальная инфекция, требовавшая другого антибиотика, чем тот, который ей назначали.
Тест помог врачам определить, какой антибиотик будет эффективен в лечении Уиллоу.
«То, что для нее был доступен этот тест, было решающим. Он спас ей жизнь», — сказала Стейси.
«Это чудо, что она здесь, и мы чрезвычайно благодарны за это», — добавил отец Уиллоу, Расс.
При правильном лечении Уиллоу удалось в конечном итоге побороть инфекцию, но ей потребовались месяцы пребывания в больнице.
Она — одна из многих пациенток детской больницы, получивших пользу от нового вида тестирования.
Результаты исследования
В ходе исследования в 2024–2025 годах метагеномное тестирование было применено к 122 тяжело больным детям в педиатрическом отделении интенсивной терапии GOSH.
Результаты теперь опубликованы в журнале Lancet Microbe.
Метагеномное тестирование анализирует весь генетический материал в образце и может обнаруживать тысячи разных патогенов.
Для сравнения, наиболее распространенный метод идентификации бактерий — это попытка вырастить их на питательных средах в чашках Петри, технология, используемая со времен викторианской эпохи.
Другой тест, ПЦР, может выявлять вирусы и некоторые бактерии, но врачи должны заранее указать, что именно они пытаются обнаружить.
Метагеномное тестирование в GOSH смогло выявить примерно девять из десяти бактерий и вирусов и всех грибов в образцах.
В одном из кварталов случаев результаты повлияли на назначение препаратов, включая начало, остановку или смену антибиотика.
Доктор Сэм Рэй, консультант по педиатрической интенсивной терапии в GOSH и соавтор исследования, сказал, что традиционные тесты требовали от клиницистов делать обоснованное предположение о том, какую инфекцию они ищут.
«Исследование помогло нам обнаружить инфекции, которые мы бы пропустили, назначить детям правильное лечение и прекратить прием антибиотиков, когда мы знаем, что они не подействуют. Устранение ненужного лечения невероятно важно в борьбе с растущей антимикробной резистентностью».
Метагеномное тестирование в GOSH также обнаружило 50 организмов, не выявленных рутинной диагностикой, что означает, что оно может сыграть роль раннего предупреждения о новых инфекциях.
Будущее метагеномики
Доктор Джулианн Браун, руководитель сервиса метагеномики GOSH и со-старший автор исследования, сказала, что новое тестирование постепенно внедряют примерно в 30 отделениях интенсивной терапии по всей Великобритании, где лечат как взрослых, так и детей.
«Это может стать мощным инструментом для выявления новых инфекций, представляющих угрозу пандемии», — добавила она.
«В будущем, если появится новый загадочный патоген, который может стать причиной следующей пандемии, мы обнаружим его очень быстро и примем надлежащие меры».
Проект в GOSH опирается на испытания в учреждении Guy’s and St Thomas’ NHS Trust, где метагеномику впервые применили для тестирования респираторных инфекций у взрослых пациентов.
